迄今为止最全面的肺细胞图谱由 Wellcome Sanger Institute 及其合作者提供,揭示了 11 种新的肺细胞类型,并提供了对参与抵抗肺部感染的免疫过程的详细了解。
今天发表在《自然遗传学》上的这一免费资源重点介绍了多种免疫细胞、屏障细胞及其在肺部的环境,这些细胞与呼吸系统疾病和感染有关。
这个新的肺细胞图谱是更广泛的国际人类细胞图谱计划的一部分,它结合了单细胞测序和空间转录组学,以更全面地描述细胞如何相互作用和相互交流。
虽然单细胞研究促进了对肺功能的理解,但肺部由复杂的结构和环境组成,单靠单细胞测序是无法研究的。例如,关于细胞的组织方式以及特定细胞类型(尤其是稀有细胞类型)如何导致肺部疾病,存在许多悬而未决的问题。
慢性肺部疾病,例如慢性阻塞性肺病 (COPD) 和间质性肺病,是全世界的主要死因。了解健康肺部局部环境中细胞之间的交流有助于确定疾病中破坏了什么,并提供有关如何预防或治疗这种情况的线索。
在这项研究中,来自 Wellcome Sanger Institute 的研究人员和合作者对来自13 名捐赠者肺组织的近 200,000 个细胞进行了基因分析,发现了 11 种新细胞类型,并显示了总共 80 种细胞类型的确切位置。
在这些新的细胞类型中,发现支气管周围成纤维细胞与 COPD 和特发性肺纤维化有关。虽然需要进一步研究来调查这些细胞是如何参与的,但这一发现证明了使用肺图谱来揭示细胞通路与疾病之间新联系的潜力。
Wellcome Sanger 研究所和 EMBL 欧洲生物信息学研究所 (EMBL-EBI) 的联合第一作者兼博士后研究员 Elo Madissoon 博士说:“通过能够分析同一肺部的多个位置,我们能够获得关键一项研究中有关一系列细胞的信息,其中许多以前没有被绘制过。此外,我们发现支气管周围成纤维细胞与慢性肺部疾病之间的联系表明,该图谱如何超越参考数据,并可以提供对疾病的新见解。”